凡是能為微生物提供生長繁殖所需碳元素的營養物質叫做碳源。在自然界,糖類,脂肪酸,石油等含碳的有機物稱為有機碳源。二氧化碳,碳酸氫鈉等含碳的無機物稱為無機碳源。微生物的碳源物質主要有:二氧化碳,碳酸氫鈉,糖類,脂肪酸,石油,花生粉餅等。
碳源是指二氧化碳氣體成分從地球表面進入大氣(如地面燃燒過程向大氣中排放CO2),或者在大氣中由其他物質經化學過程轉化為二氧化碳氣體成分(如大氣中的CO被氧化為CO2,對于CO來說也叫碳源)